algunas actualizaciones del skel generan conflictos
especialmente en _config.yml porque a veces lo modificamos y los sitios también. me parece que la forma de evitarlo sería hacer un plugin que solo tenga include: _data/config/*.yml
o algo asi y solo tengamos que poner y sacar archivos individuales de ese directorio.
otra cosa que pasa es que al correr bundler se instalan las gemas desde gems.sutty.nl y se modifica el Gemfile.lock pero no se vuelve a resetear, eso pararía todas las actualizaciones.
al menos esto sucede en un git pull comun y corriente, no tengo claro si rugged hace lo mismo...